La microbiota intestinal se ha relacionado con diversos trastornos neurológicos a través del eje intestino-cerebro. La dieta influye en la composición de la microbiota intestinal. La dieta cetogénica (KD) es una dieta alta en grasas, adecuada en proteínas y baja en carbohidratos establecida para el tratamiento de la epilepsia resistente a la terapia en niños. Se ha confirmado su eficacia para reducir las convulsiones, pero los mecanismos siguen siendo esquivos. La dieta también ha mostrado efectos positivos en una amplia gama de otras enfermedades, como el Alzheimer, la depresión, el autismo, el cáncer y la diabetes tipo 2. Recolectamos muestras fecales de 12 niños con epilepsia resistente a la terapia antes de comenzar KD y después de 3 meses con la dieta. Los padres no comenzaron KD y sirvieron como controles de dieta. Aplicando secuenciación de ADN metagenómico de escopeta, se establecieron perfiles taxonómicos y funcionales.
Aquí se informa de que la diversidad alfa no cambia significativamente durante la dieta, pero se detectan diferencias en la composición taxonómica y funcional. Abundancia relativa de bifidobacterias, así comoE. rectale y Dialister, disminuyen significativamente durante la intervención. Se observa un aumento en la abundancia relativa de E. coli en KD.