Las dietas cetogénicas (KD) muy bajas en carbohidratos y altas en grasas inducen un cambio pronunciado en la utilización del combustible metabólico que eleva los cuerpos cetónicos circulantes; sin embargo, las consecuencias de estos compuestos para las interacciones huésped-microbioma siguen siendo desconocidas. Aquí se plasma que los KD alteran la microbiota intestinal humana y de ratón de una manera distinta de las dietas ricas en grasas (HFD). Los análisis metagenómicos y metabólicos de las muestras de heces de un estudio hospitalario de 8 semanas revelaron cambios marcados en la estructura y función de la comunidad microbiana intestinal durante la KD. Los experimentos de dieta con gradientes en ratones confirmaron el impacto único de los KD en relación con los HFD con un agotamiento reproducible de las bifidobacterias.