La colonización in vivo por diferentes cepas de Lactobacillus en la mucosa intestinal humana de voluntarios sanos se estudió junto con el efecto de la administración de Lactobacillus en diferentes grupos de bacterias indígenas. Se administraron un total de 19 cepas de prueba en sopa de avena fermentada que contenía 5 x 10 (6) UFC de cada cepa por ml utilizando una dosis de 100 ml de sopa por día durante 10 días. Se tomaron biopsias tanto del yeyuno superior como del recto 1 día antes de comenzar la administración y 1 y 11 días después de finalizar la administración. La administración aumentó significativamente los recuentos de Lactobacillus en la mucosa del yeyuno, y los niveles altos se mantuvieron 11 días después de la finalización de la administración. Los niveles de estreptococos aumentaron de 10 a 100 veces en dos personas, y los niveles de clostridios reductores de sulfito en el yeyuno disminuyeron de 10 a 100 veces en tres de los voluntarios 1 día después de finalizar la administración. En recta, los recuentos de bacterias anaerobias y los recuentos de bacterias anaerobias gramnegativas disminuyeron significativamente al final de la administración. Además, se observó una disminución en el número de miembros de Enterobacteriaceae en 1,000 veces en la mucosa rectal de dos personas. Los aislados de Lactobacillus seleccionados al azar se identificaron fenotípicamente mediante pruebas API 50CH y genotípicamente mediante los perfiles de plásmidos de cepas y mediante análisis de restricción de endonucleasa de ADN cromosómico .