Taxonomía numérica de Lactobacillus spp. asociado con la mucosa sana y enferma del intestino humano

Doscientas cincuenta cepas de Lactobacillus aisladas de la mucosa sana y enferma del intestino humano de 75 individuos y 49 cepas de referencia se clasificaron fenotípicamente utilizando 49 caracteres unitarios. Los datos fueron procesados ​​por los coeficientes Jaccard (SJ) y Simple Matching (SSM), y el algoritmo de grupo de pares no ponderados con promedios aritméticos. Diecisiete grupos principales se definieron en el nivel de similitud SJ del 76% que corresponde aproximadamente al nivel de SSM del 91%. Se pudieron identificar siete grupos: Lactobacillus plantarum (aislamientos recuperados del 5% de los pacientes), Lact. casei subsp. rhamnosus (17% de los pacientes), Lact. casei subsp. pseudoplantarum (5% de los pacientes), Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides (3% de los pacientes), Lact. buchneri (4% de pacientes), Lact. reuteri (4% de los pacientes) y Lact. salivarius subsp. salivarius (9% de los pacientes). Los grupos 1 y 3 no asignados contenían ambas cepas de Lactobacillus homofermentativas. El grupo 1 incluía las cepas tipo de Lact. crispatus, Lact. acidophilus, Lact. jensenii y Lact. gasseri, y el grupo 3, las cepas tipo de Lact. delbrueckii subsp. lactis, Lact. agilis y Lact. casei subsp. tolerans. Los grupos 1 y 3 se encontraron en el 15% y el 25% de los pacientes, respectivamente. Los grupos no asignados 2, 6, 7, 8 y 10 contenían cepas de Lactobacillus homofermentativas pero no cepas de referencia. Los grupos 11, 12, 15 y 17 estaban formados por cepas heterofermentativas de Lactobacillus pero sin cepas de referencia. Se dan características fenotípicas de los grupos. No se pudieron observar tendencias obvias en la composición de especies (grupos) entre diferentes ubicaciones intestinales. La mayoría de los grupos contenían aislamientos de mucosa sana y enferma. Las excepciones fueron el grupo 15 y el grupo 17 que solo incluyeron aislamientos de mucosa sana, y el grupo 11 que solo incluyó aislamientos de mucosa enferma. El grupo 15 se aisló en el 12% de los pacientes y el grupo 11 en el 8%.

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